Małgorzata Krzyżowska prowadzi działalność naukową w obszarze zastosowania nanotechnologii do konstrukcji nowych środków bakterio- i wirusobójczych.

Kierowała i brała udział w ponad 20 projektach naukowych, w tym projektach międzynarodowych. Trzykrotna stypendystka Marie Curie Actions – Marie Curie
Intra-European Fellowship, European Reintegration Grant oraz Mobility for Regional Excellence 2020 oraz uczestniczka programów badawczych w ramach stypendium NAWA, EFIS, MoRE2020 i Svenska Institutet (Francja, Szwecja). Pracownik Karolinska Institutet
w Sztokholmie (2007-2010) oraz University of Gothenburg (2017,2019-2021).

W 2002 r. obroniła doktorat na Wydziale Weterynarii Szkoły Głównej Gospodarstwa Wiejskiego w Warszawie, a w 2014 r. na Wydziale Lekarskim Uniwersytetu Medycznego
w Białymstoku uzyskała stopień doktora habilitowanego. W 2023 postanowieniem Prezydenta RP otrzymała tytuł profesora nauk medycznych i nauk o zdrowiu.

Od lat aktywnie współpracuje z przemysłem w zakresie testowania nowych środków biobójczych oraz wyrobów medycznych pod kątem ich właściwości bójczych oraz ich biozgodności

W sferze naukowej współpracuje m.in. z Siecią Badawczą Łukasiewicz – Polskim Ośrodkiem Rozwoju Technologii PORT oraz Instytutem Włókiennictwa w Łodzi, Wydziałem Inżynierii Materiałowej Politechniki Warszawskiej, Zakładem Farmacji Stosowanej Uniwersytetu Medycznego w Białymstoku, Katedrą Technologii i Chemii Materiałów Wydziału Chemii, Uniwersytetu Łódzkiego, oraz z ośrodkami zagranicznymi: Department of Reumatology and Inflammation Research Institute of Medicine University
of Gothenburg, Geteborg, Szwecja. – Department of Physics, Chalmers University
of Technology, Geteborg, Szwecja oraz Cystic Fibrosis Group; Pasteur Institute and Hôpital Saint-Antoine, Francja.